Corte uma rodela de cerca de 1,5 cm da parte de cima de cada tomate. Deite fora a parte superior. Com uma faca pequena, corte à volta do interior da parte da polpa do tomate (não corte a base do tomate) até cerca de 1 cm da pele do tomate. Com uma colher de chá, retire o interior do tomate, deixando cerca de 1 cm da polpa agarrada à pele. Deite fora o sumo e as sementes para deixar espaço para o ratatouille. Ponha um pouco de sal no interior dos tomates e vire-os, com as partes cortadas para baixo, sobre uma travessa revestida com papel absorvente enquanto prepara o ratatouille.
Pincele ligeiramente ou borrife a cebola, o pimento e a courgette com azeite. Tempere com sal e pimenta a gosto. Grelhe em lume médio directo (175 °C a 230 °C), com a tampa fechada o máximo possível, até ficarem tenros, virando uma só vez. As cebolas demoram entre 8 a 12 minutos a assar. O pimento e a courgette demoram entre 6 a 8 minutos. Passe para uma tábua de corte e pique em pedaços de cerca de 1 cm. Numa tigela média, misture os legumes grelhados com o queijo, o manjericão e vinagre.
Com uma colher, coloque o ratatouille nos tomates. Grelhe os tomates em lume médio indirecto até o queijo derreter e os legumes aquecerem, durante 8 a 12 minutos. Servir de imediato.