Tagliate una fettina di 1,5 cm dall'estremità superiore di ciascun pomodoro e gettatela via. Servendovi di un coltellino incidete la parte intorno alla polpa del pomodoro (non scendete fino all'estremità inferiore) a circa 1,5 cm dalla pelle. Con un cucchiaino rimuovete la polpa lasciandone circa 1,5 cm attaccata alla pelle. Gettate via il succo e i semi per far spazio alla ratatouille. Salate la cavità interna dei pomodori e disponeteli a testa in giù su un piatto ricoperto di carta assorbente mentre preparate la ratatouille.
Tagliate le verdure, ad esclusione dei pomodori, in piccoli pezzi di uguali dimensioni e, in una ciotola, conditele con olio, sale e pepe.
Trasferite il tutto in un vassoio per verdure e fate cuocere in cottura diretta con il coperchio chiuso, girando di tanto in tanto, finché non si saranno abbrustolite superficialmente, quindi spostate il vassoio sul calore indiretto fino a che le verdure non saranno tenere. Unite le verdure grigliate in una ciotola media insieme al formaggio, al basilico e all'aceto.
Aiutandovi con un cucchiaio, farcite i pomodori con la ratatouille. Cuocete i pomodori a cottura indiretta per 8-12 minuti, finché il formaggio non fonde e le verdure non si riscaldano. Servite immediatamente.